La scène d'ouverture nous montre Marisa à la tête de son armée et prête à aller affronter Asriel. Ce dernier profite de ses retrouvailles avec Lyra qui ne se passe aussi bien que prévu car il maintient qu'il ne l'a pas faite venir à elle. Elle est furieuse de sa réaction d'autant plus qu'il la prend de haut. Elle répond qu'elle a traversé de nombreux pays et affronter milles périls pour lui apporter quelque chose. Quelque chose qu'elle ne lui donnera qu'à la condition qu'il lui dise pourquoi il lui a caché la vérité à propos du fait qu'il soit son père. Surpris qu'elle le sache, il ne cherche pas à le dissimuler mais parvient à tourner la situation à son avantage. Vexée, elle lui remet l'aléthiomètre en indiquant que le Maître de Jordan College le lui a donné avant son départ. Asriel refuse de le prendre en affirmant ne pas en avoir besoin et ajoute que le Maître ne lui a pas explicitement indiqué de le lui remettre : c'est Lyra qui s'est attribuée cette mission.
Nous retrouvons Marisa en pleine discussion avec le père MacPhail à propos d'Asriel et de ses travaux. L'homme de foi s'inquiète de ces derniers et souhaite qu'ils disparaissent en même temps que leur inventeur. Marisa est plus mitigée et elle clame que les découvertes de son ancien amant ne lui font pas peur. MacPhail est stupéfait et pense que son ennemi exerce encore sur elle une forte attraction qui la pousse à se ranger, en partie du moins, à ses côtés. Il dit ne pas la reconnaître, qu'elle n'est plus la femme qu'elle était avant sa rencontre avec Asriel et la naissance de leur enfant. Enfant qu'elle n'a pas élevé et qu'elle a rejeté. Marisa répond qu'il n'est pas non plus exempt de tous péchés et qu'il envie ce qu'Asriel et elle possèdent. Elle ajoute alors qu'elle est sa meilleure chance de l'atteindre.
Au Magisterium, Lord Boreal a demandé à Fra Pavel d'interroger l'aléthiomètre pour lui. Ce dernier lui apprend que la réponse à sa question, "qu'a découvert Grumman", indique que son fils le conduira à un poignard conservé dans une tour cernée par des anges. Boreal est surpris car, à sa connaissance, Grumman n'a pas de fils. Il comprend alors que Grumman et John Parry ne sont qu'une seule et même personne.
Dans le laboratoire d'Asriel, celui-ci a repris ses expériences et se prépare à y apporter la touche finale. Thorold lui reproche de ne pas avoir pris le temps de s'intéresser à Lyra et de lui dire au revoir en bonne et dûe forme. Asriel est effectivement sur le départ car il souhaite avoir déjà quitté les lieux lorsque le Magisterium arrivera. Il demande à son valet de prendre soin de Lyra. En parallèle, Lyra prend un bain chaud et discute avec Pan et Roger de son envie de partir dès le lendemain. Epuisés, ils finissent par se coucher et s'endormir. Au milieu de la nuit, Asriel réveille Lyra pour lui parler de la Poussière. Il dit que le Magisterium pense qu'elle représente le péché ou du moins sa manifestation physique, héritée de la nuit du temps. L'histoire est en effet liée celle du péché originel, commis par Adam et Eve, et la Poussière entrerait depuis en les Humains à l'adolescence pour les pervertir. Asriel annonce alors qu'il combat cette idée parce que rien ne la corrobore, il pense d'ailleurs que la Poussière serait en fait issue d'un autre monde caché derrière les aurores boréales visibles dans le Nord. Il ajoute que la Poussière est ce qui fait fonctionner l'aléthiomètre et qu'il rêve de bâtir un pont entre les mondes pour découvrir la source de la Poussière mais également défier l'Autorité et le Magisterium. Il laisse ensuite retomber dans le sommeil.
Plus tard, Lyra est réveillée par Thorold qui lui annonce qu'Asriel a emmené Roger avec lui (sous prétexte de préparer une surprise pour Lyra) pour s'en servir afin de déclencher le mécanisme qui lui permettra de bâtir son pont. Pour ce faire, il coupera Roger de son daemon ce qui causera la mort de l'enfant. Horrifiée parce qu'elle entend, elle fuit avec Iorek dans le but d'empêcher que cela se produise et échappe donc aux hommes du Magisterium qui arrivent sur place. Là Marisa discute avec Thorold et découvre le plan d'Asriel, elle s'en va ensuite en laissant ses hommes derrière elle. Sur le chemin qui la conduit à Roger, Iorek et ses orus sont pris pour cibles par les hommes du Magisterium. Iorek laisse momentanément ses pairs derrière lui pour approcher la fillette le plus près possible de sa destination cependant, un pont de glace l'empêche de l'accompagner jusqu'au bout du voyage. C'est donc seule que Lyra atteint le sommet de la montagne où Asriel s'est installé. Elle découvre que Roger et son daemon ont été enfermés dans des cages mais elle ne peut agir et c'est impuissante qu'elle voit la lame couper le lien unissant son ami à son daemon. Roger meurt sous ses yeux et une vive lumière s'échappe alors permettant de créer une brèche entre deux mondes. Marisa arrive alors et Lyra, toujours cachée de ses parents, assiste à leurs retrouvailles. Ils s'embrassent passionnément. Asriel avoue ensuite à son ancienne amante l'origine réelle de la Poussière et lui propose de le suivre dans ce nouveau monde mais Marisa refuse arguant qu'elle doit rester dans ce monde et trouver Lyra. Asriel, comprenant qu'il ne la fera pas changer et qu'elle est honnête pour la première fois depuis bien longtemps, traverse donc le pont sans elle. Marisa repart également. Lyra serre contre elle le cadavre de son ami en se lamentant de l'aller entraîné dans cette histoire qui a causé sa mort. Elle regrette de ne pas lui avoir dit au revoir puis reprend courage et décide de traverser le pont pour partir à la recherche de la Poussière, qu'elle pense être bonne puisque tout le monde (les adultes) dit le contraire.
Dans le monde de Will, Carlo découvre le décès de son associé (Thomas) et fait avertir la police à propos de la disparition de Will. Peu après, dans ce café, l'adolescent est repéré par un policier mais il parvient à prendre la fuite avant d'être attrapé. A force de fuir, Will finit par se retrouver au Jardin botanique d'Oxford où il trouve, grâce à un chat errant, une fenêtre ouvrant sur un autre monde. Il l'emprunte.